První obrovskou láskou byla tato herečka, se kterou se seznámil během natáčení filmu Střihoruký Edward. Dali se dohromady a vypadalo to, že navždy. Johnny si dokonce nechal vytetovat Winona Forever ovšem po třech letech to musel změnit na Wino Forever (opilec navždy). 

Zatímco Johnny zakotvil v náručí další krásky, Winona se zhroutila a začala dokonce vyhrožovat sebevraždou, pokud se k ní nevrátí. Nevrátil. Několikrát skončila na odvykací klinice kvůli závislosti na uklidňujících prášcích. 

Po psychické stránce se z rozchodu už nikdy nevzpamatovala a skončila jako tragická kleptomanka, která byla několikrát nachytána při krádežích v obchodech.

Další velkou láskou se stala modelka Kate Moss. Seznámili se v době, kdy se Johnny rozhodl definitivně skončit s drogami, po tragické smrti předávkováním svého kamaráda, herce Rivera Phoenixe. Odešel na léčení a skutečně se svého návyku zbavil.

S krásnou Kate to vypadalo slibně, došlo i k několika zasnoubením, která ale byla všechna postupně zrušena, jako nakonec celý vztah. Stejně jako Winona, rozchod nesla těžce. Zhubla až na hranici vyhladovění a začala brát drogy.

Ale nevzdala se a drog se definitivně zbavila. Od roku 2011 je štastně vdaná za hudebníka Jameiho Hince, se kterým má dceru Lilu.